曾任上海市委政研室处长，上海浦东新区管理委员会政策研究室主任，中共浦东新区党校常务副校长，中共中央办公厅曾庆红同志秘书，中央办公厅调研室政治组长、副主任，中央政策研究室副主任。

2013年至今任十二届全国政协社会和法制委员会副主任。

先后参与了党的十六大、十七大、十八大、十九大文件起草和党的十五届六中全会、十六届四中全会、十七届四中全会和十七届六中全会文件起草。把“幸福着人民的幸福，忧患着人民的忧患”，作为从事党的政策研究和文件起草工作的理念，

著述有《当代中国的主义和问题》、《改革潮头雪浪花》等。

十七大之后，施芝鸿成为习近平的助手，习近平出访、会见、调研考察，施芝鸿几乎都陪同参加。十八大报告发布后，到各地做了超过30场十八大专题讲座。把邓小平理论、三个代表、科学发展观喻为中国改革已经摸到的“三块石头”，引发各界讨论。十九大后作为中央宣讲团成员到多地巡讲十九大精神。